rechèchbg

Jenetik popilasyon sou tout jenòm lan ak siveyans molekilè rezistans ensektisid nan moustik Anopheles nan Sebatkilo, Awash, Etyopi

Depi yo te dekouvri moustik Azyatik Anopheles stephensi a nan Djibouti an 2012, li gaye toupatou nan kòn Afrik la. Vektè envazif sa a kontinye gaye sou tout kontinan an, sa ki reprezante yon menas grav pou pwogram kontwòl malarya yo. Metòd kontwòl vektè yo, tankou moustikè trete ak ensektisid ak flite rezidyèl andedan kay la, te diminye chay malarya a anpil. Sepandan, ogmantasyon prevalans moustik rezistan a ensektisid yo, tankou popilasyon Anopheles stephensi yo, ap antrave efò eliminasyon malarya ki kontinye ap fèt yo. Konprann estrikti popilasyon an, sikilasyon jèn ant popilasyon yo, ak distribisyon mitasyon rezistans ensektisid yo esansyèl pou gide estrateji kontwòl malarya efikas.
Li enpòtan pou nou amelyore konpreyansyon nou sou kijan An. stephensi te vin etabli tèt li nan HOA a pou nou ka predi potansyèl li pou l gaye nan nouvo zòn. Yo te itilize jenetik popilasyon anpil pou etidye espès vektè yo pou yo ka konprann estrikti popilasyon an, seleksyon kontinyèl la, ak sikilasyon jèn18,19. Pou An. stephensi, etidye estrikti popilasyon an ak estrikti jenòm lan ka ede klarifye wout envazyon li ak nenpòt evolisyon adaptasyon ki ka fèt depi aparisyon li. Anplis sikilasyon jèn, seleksyon an patikilyèman enpòtan paske li ka idantifye alèl ki asosye ak rezistans ensektisid epi klarifye kijan alèl sa yo ap gaye nan popilasyon an20.
Jiska prezan, tès makè rezistans ensektisid ak jenetik popilasyon nan espès envazisan Anopheles stephensi a te limite a kèk jèn kandida. Aparisyon espès la ann Afrik poko byen konprann, men yon ipotèz se ke li te entwodui pa moun oswa bèt. Gen lòt teyori ki gen ladan migrasyon long distans pa van. Izola Etyopyen yo itilize nan etid sa a te kolekte nan Awash Sebat Kilo, yon vil ki sitiye 200 km nan lès Addis Abeba e ki sou prensipal koridò transpò ki soti Addis Abeba pou rive Djibouti. Awash Sebat Kilo se yon zòn ki gen yon gwo transmisyon malarya e ki gen yon gwo popilasyon Anopheles stephensi, ki yo rapòte kòm rezistan a ensektisid, sa ki fè li yon sit enpòtan pou etidye jenetik popilasyon Anopheles stephensi8.
Yo te detekte mitasyon rezistans ensektisid kdr L1014F la nan yon frekans ki ba nan popilasyon Etyopyen an epi yo pa t detekte l nan echantiyon jaden Endyen yo. Mitasyon kdr sa a konfere rezistans a piretroyid ak DDT epi yo te deja detekte l nan popilasyon An. stephensi yo te kolekte nan peyi Zend an 2016 ak Afganistan an 2018.31,32 Malgre prèv rezistans piretroyid toupatou nan tou de vil yo, yo pa t detekte mitasyon kdr L1014F la nan popilasyon Mangalore ak Bangalore nou te analize isit la. Ti pwopòsyon izolat Etyopyen ki te pote SNP sa a ki te etewozigòt sijere ke mitasyon an te parèt dènyèman nan popilasyon sa a. Sa a sipòte pa yon etid anvan nan Awash ki pa jwenn okenn prèv mitasyon kdr nan echantiyon yo te kolekte nan ane anvan sa yo analize isit la.18 Nou te deja idantifye mitasyon kdr L1014F sa a nan yon frekans ki ba nan yon seri echantiyon ki soti nan menm rejyon/ane a lè l sèvi avèk yon apwòch deteksyon anplikon.28 Etandone rezistans fenotipik la nan sit echantiyonaj yo, frekans alèl ki ba nan makè rezistans sa a sijere ke mekanis lòt pase modifikasyon sit sib la responsab pou fenotip sa a obsève.
Yon limitasyon nan etid sa a se mank done fenotipik sou repons ensektisid. Plis etid ki konbine sekansyasyon jenòm konplè (WGS) oswa sekansyasyon anplikon sible an konbinezon ak byotès sansibilite yo nesesè pou envestige enpak mitasyon sa yo sou repons ensektisid. Nouvo SNP sans sa yo ki ka asosye avèk rezistans ta dwe vize pou tès molekilè wo-debi pou sipòte siveyans epi fasilite travay fonksyonèl pou konprann ak valide mekanis potansyèl ki asosye avèk fenotip rezistans yo.
An rezime, etid sa a bay yon konpreyansyon pi pwofon sou jenetik popilasyon moustik Anopheles atravè kontinan yo. Aplikasyon analiz sekansaj jenòm konplè (WGS) sou pi gwo gwoup echantiyon nan diferan rejyon jewografik yo pral esansyèl pou konprann sikilasyon jèn epi idantifye makè rezistans ensektisid. Konesans sa a pral pèmèt otorite sante piblik yo fè chwa enfòme nan siveyans vektè ak itilizasyon ensektisid.
Nou te itilize de apwòch pou detekte varyasyon nan kantite kopi nan seri done sa a. Premyèman, nou te itilize yon apwòch ki baze sou pwoteksyon ki te konsantre sou gwoup jèn CYP idantifye nan jenòm lan (Tablo Siplemantè S5). Nou te kalkile mwayèn pwoteksyon echantiyon an atravè kote koleksyon yo epi nou te divize l an kat gwoup: Etyopi, jaden Endyen yo, koloni Endyen yo, ak koloni Pakistane yo. Nou te normalize pwoteksyon pou chak gwoup lè l sèvi avèk lisaj nwayo a epi answit nou te trase l dapre pwofondè medyàn pwoteksyon jenòm lan pou gwoup sa a.


Dat piblikasyon: 23 jen 2025